Institutionens ledningsgrupps uppgift är att regelbundet överlägga i frågor av operativ natur för den löpande driften. Institutionen leds av prefekten med stöd av proprefekt, viceprefekter, administrativ chef, avdelningschefer, HR-partner och kommunikationspartner.
Prefekt (t o m 31 april 2026): Fredrik Hedenus
Prefekt (f o m 1 maj 2026): Lena Neij
Tf Viceprefekt grundutbildning: Simon Harvey
Tf Viceprefekt forskarutbildning: David Pallarès
Avdelningschef Energiteknik: Henrik Thunman
Avdelningschef Fysisk resursteori: Jonas Nässén
Avdelningschef Geovetenskap och Fjärranalys: Lars Ulander
Avdelningschef Maritim miljövetenskap: Ida-Maja Hassellöv
Avdelningschef Miljösystemanalys: Magdalena Svanström
Avdelningschef verksamhetsstöd: Camilla Kolm
Controller: Maria Karlsson
HR-partner: Madelene Olsson
Kommunikationspartner: Christian Löwhagen
Ledningsstöd: Klas Leifland Taieb