– Vi drivs av att göra nytta, säger Åsa Björklund som leder teamet för den nationella forskningsinfrastrukturen CSBI, Computational Systems Biology Infrastructure vid Chalmers. Här får forskare hjälp med allt från att planera sina studier till att analysera stora datamängder samt även långsiktigt stöd i större forskningsprojekt. Teamet har en bred kompetens inom bioinformatik och ett stort nätverk både nationellt och internationellt.
Bioinformatik, som kombinerar statistik, biologi och datavetenskap, gör det möjligt att tolka och använda stora mängder biologisk data. CSBI, är en del av NBIS, National Bioinformatics Infrastructure Sweden, som finns representerad vid alla stora lärosäten i Sverige. Totalt omfattar nätverket omkring 130 personer med olika specialiseringar.
– Det är väldigt unikt att ha en så stor infrastruktur inom området, menar Åsa Björklund. Hon är forskare vid institutionen för Life Sciences på Chalmers och inom NBIS leder hon forskningsområdet Cell- och molekylärbiologi. De är också en del av SciLifeLab där de utgör plattformen för bioinformatik.
Olika erbjudanden
– Vi får många olika typer av frågor från forskare som är i olika faser av sina projekt. Vi rekommenderar att ta kontakt med oss så tidigt som möjligt så att vi kan hjälpa till med strukturen från början, vilket kan leda till ett bättre resultat senare. Men ibland kommer vi också in i slutfasen av analysen, det beror helt enkelt på hur behoven ser ut, säger hon.
Genom NBIS har varje forskargrupp tillgång till tre timmars kostnadsfri rådgivning. Därefter kan man få fortsatt stöd mot en timkostnad. För mer långsiktig hjälp finns även möjlighet att ansöka om kostnadsfri support i form av WABI, Wallenberg Advanced Bioinformatics Infrastructure, vilket omfattar 500 timmar över ett till två år och finansieras av Knut och Alice Wallenberg Stiftelse. Ansökan är öppen tre gånger om året och projekten väljs ut av en extern kommitteé. För större forskningsprojekt går det också att hyra in en expert.
Utöver detta erbjuder teamet också regelbundet kurser samt anordnar drop-in sessioner där forskare kan komma och diskutera sina projekt.
Att vara med på resan
– Nätverket är sprunget ur ett stort engagemang och driv. Det har växt långsamt, vilket har gett både en bra struktur och ett stort kontaktnät. Det är väldigt spännande när vi får vara med och se ett projekt växa fram och extra tillfredsställande när vi kan stötta forskarna och verkligen göra nytta, kommenterar Åsa.
Teknikutvecklingen gör att allt större datamängder kan genereras, vilket samtidigt ställer krav på avancerad analys. För klinisk data tillkommer dessutom regelverk kring säkerhet och hantering av personuppgifter. Även inom dessa områden finns specialistkompetens inom teamet.
På frågan om vad som är nästa steg svarar hon:
– Det handlar hela tiden om att ligga i framkant och hålla oss uppdaterade om de senaste teknikerna. Men framför allt handlar det om att vi vill finnas där vi behövs, tillsammans växer vi med kunskap.
Vill du veta mer?
Hör gärna av dig till Åsa om du vill veta mer, eller besök drop‑in‑sessionerna varannan onsdag (jämna veckor) kl. 13.00–14.00 i lunchrummet på våning 1, Kemigården (Fysikhuset).
- Forskare, Infrastrukturer, Life Sciences