Kursplan för Avancerad bioanalytisk kemi: metabolomik och proteomik

Kursplan fastställd 2019-02-12 av programansvarig (eller motsvarande).

Kursöversikt

  • Engelskt namnAdvanced analytical chemistry: metabolomics and proteomics
  • KurskodBBT020
  • Omfattning7,5 Högskolepoäng
  • ÄgareMPBIO
  • UtbildningsnivåAvancerad nivå
  • HuvudområdeBioteknik
  • InstitutionBIOLOGI OCH BIOTEKNIK
  • BetygsskalaTH - Mycket väl godkänd (5), Väl godkänd (4), Godkänd (3), Underkänd

Kurstillfälle 1

  • Undervisningsspråk Engelska
  • Anmälningskod 08137
  • Max antal deltagare30
  • Sökbar för utbytesstudenterJa

Poängfördelning

0117 Tentamen 3,5 hp
Betygsskala: TH
3,5 hp
  • 01 Jun 2021 em J
  • 09 Okt 2020 em J
  • 24 Aug 2021 fm J
0217 Projekt 4 hp
Betygsskala: TH
4 hp

    I program

    Examinator

    Gå till kurshemsidan (Öppnas i ny flik)

    Behörighet

    Grundläggande behörighet för avancerad nivå
    Sökande med en programregistrering på ett program där kursen ingår i programplanen undantas från ovan krav.

    Särskild behörighet

    Engelska 6
    Sökande med en programregistrering på ett program där kursen ingår i programplanen undantas från ovan krav.

    Kursspecifika förkunskaper

    Innan man tar denna kurs bör man ha läst och klarat KAM021 Avancerad analytisk kemi, eller ha erfarenhet som liknar kursen.

    Syfte

    Syftet med kursen är att ge en överblick av metabolomik och proteomik, och hur de används inom biologisk forskning.

    Lärandemål (efter fullgjord kurs ska studenten kunna)

    • Designa ett metabolomik- eller proteomikexperiment
    • Kritiskt evaluera användning av olika metoder för metabolomik och proteomik
    • Kritiskt evaluera olika dataanalysverktyg
    • Förstå integrering av metabolomik och proteomik data med andra typer av data

    Innehåll

    Nya analytiska verktyg möjliggör förståelse av komplexa biologiska system, hur de fungerar och hur de kan manipuleras. Bland de nya analytiska verktygen är metabolomik och proteomik metoder som mäter så många metaboliter och proteiner som möjligt. Metabolomik och proteomik kan ge ny insikt i samband mellan olika metaboliska reaktioner, och används regelbundet i både akademiska och industriella forskningsmiljöer. Förutom i biologisk grundforskning, används metabolomik och proteomik i livsmedels- och hälsovetenskaper.

    Under denna kurs får du en bred överblick av vad som är möjligt med metabolomik och proteomik, samt praktiska tillämpningar. Du får också möjlighet att generera dina egna labb-baserade data, som blir grunden till de praktiska momenten med dataanalys och projektet.

    Kursen innehåller följande huvudområden:
    • Metabolomik med NMR och masspektrometri
    • Proteomik
    • Avancerade applikationer av proteomik (glykoproteomik, fosfoproteomik)
    • Försöksplanering och provberedning
    • Tillämpningar av metabolomik och proteomik inom industri
    • Fluxomik
    • Masspektrometri-baserad avbildningsmetabolomik
    • Multivariat dataanalys för metabolomik och proteomik
    • Integration av metabolomik- och proteomikdata

    Organisation

    Kursen består av föreläsningar, studiebesök, labbövningar och ett projekt.

    Litteratur

    Det finns ingen kursbok för denna kurs.  Studenter ska få relevant litteratur under kursen och förväntas att söka information via internet. 

    Examination inklusive obligatoriska moment

    Kursbetyg är baserade på projektarbetet, ett seminarium, labbrapporter, och en skriftlig tenta.