Fredrik Westerlund

Bitr. professor; Biologi och Bioteknik
Avdelningschef för Kemisk Biologi

fredrik.westerlund@chalmers.se +46317723049 Hitta till mig http://orcid.org/0000-0002-4767-4868

Fredrik Westerlunds forskargrupp studerar enstaka DNA-molekyler in nanokanaler med hjälp av fluorescensmikroskopi. Fokus ligger både på att utveckla nya metoder för att kartlägga DNA sekvenser så väl som att studera DNA-proteininteraktioner.

Westerlunds Forskningsgrupp

Publikationer - ResearcherID

Undervisning
Publikationer
Samverkan och projekt

Biofysikalisk kemi (KFK021), Föreläsare

Senaste publikationer

2021
Optical dna mapping of plasmids reveals clonal spread of carbapenem-resistant klebsiella pneumoniae in a large thai hospital

Författare: Sriram Kesarimangalam; Tsegaye Sewunet; Walaiporn Wangchinda; Teerawit Tangkoskul; Visanu Thamlikitkul; Christian G. Giske; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2021

Publicerat i: Antibiotics

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Complex conformational dynamics of the heart failure‐associated pre‐mirna‐377 hairpin revealed by single‐molecule optical tweezers

Författare: Anna Wiktoria Wypijewska Del Nogal; Vinoth Sundar Rajan; Fredrik Westerlund; Marcus Wilhelmsson

Publiceringsår: 2021

Publicerat i: International Journal of Molecular Sciences

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
C-terminal truncation of α-synuclein alters DNA structure from extension to compaction

Författare: Kai Jiang; Sandra Rocha; Ranjeet Kumar; Fredrik Westerlund; Pernilla Wittung Stafshede

Publiceringsår: 2021

Publicerat i: Biochemical and Biophysical Research Communications

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Mechanical characterization of base analogue modified nucleic acids by force spectroscopy

Författare: Vinoth Sundar Rajan; Xavier Viader-Godoy; Yii Lih Lin; Uttama Dutta; Fredrik Westerlund; Marcus Wilhelmsson

Publiceringsår: 2021

Publicerat i: Physical Chemistry Chemical Physics

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Identity of blactx-m carrying plasmids in sequential esbl-e. Coli isolates from patients with recurrent urinary tract infections

Författare: N. Karami; Sriram Kesarimangalam; Shora Yazdanshenas; Yii Lih Lin; Daniel Jaén-Luchoro; Elina Ekedahl; Sanjana Parameshwaran; Anna Lindblom; Christina Åhrén; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2021

Publicerat i: Microorganisms

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Shining light on single-strand lesions caused by the chemotherapy drug bleomycin

Författare: Vandana Singh; Pegah Johansson; Yii Lih Lin; Ola Hammarsten; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2021

Publicerat i: DNA Repair

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
The HIV-1 nucleocapsid chaperone protein forms locally compacted globules on long double-stranded DNA

Författare: Kai Jiang; Nicolas Humbert; Sriram Kesarimangalam; I. Rouzina; Yves Mely; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2021

Publicerat i: Nucleic Acids Research

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Single Molecule Experiments Define the Role of Nbs1 and Xrs2 in DNA Tethering by MRN and MRX in DSB Repair

Författare: Carl Ivar Möller; Rajhans Sharma; Robin Öz; Giordano Reginato; Elda Cannavo; Sriram Kesarimangalam; Petr Cejka; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2021

Publicerat i:

Publikationstyp: Övrigt konferensbidrag
Dynamics of Ku and bacterial non-homologous end-joining characterized using single DNA molecule analysis

Författare: Robin Öz; Jing L. Wang; Raphael Guerois; Gaurav Goyal; Sriram Kesarimangalam; Virginie Ropars; Rajhans Sharma; Firat Koca; Jean Baptiste Charbonnier; M. Modesti; Terence R. Strick; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2021

Publicerat i: Nucleic Acids Research

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Polyphasic characterization of carbapenemresistant Klebsiella pneumoniae clinical isolates suggests vertical transmission of the blaKPC-3gene

Författare: Catarina Ferreira; Santosh Kumar Bikarolla; Karolin Frykholm; Saga Pohjanen; Margarida Brito; Catarina Lameiras; O. C. Nunes; Fredrik Westerlund; C. M. Manaia

Publiceringsår: 2021

Publicerat i: PLoS ONE

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
2020
Stabilization of G-quadruplex DNA structures in Schizosaccharomyces pombe causes single-strand DNA lesions and impedes DNA replication

Författare: Ikenna Obi; Matilda Rentoft; Vandana Singh; Jan Jamroskovic; Karam Chand; E. Chorell; Fredrik Westerlund; Nasim Sabouri

Publiceringsår: 2020

Publicerat i: Nucleic Acids Research

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Optical maps of plasmids as a proxy for clonal spread of MDR bacteria: A case study of an outbreak in a rural Ethiopian hospital

Författare: Yii Lih Lin; Tsegaye Sewunet; Sriram Kesarimangalam; Christian G. Giske; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2020

Publicerat i: Journal of Antimicrobial Chemotherapy

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Real-time compaction of nanoconfined DNA by an intrinsically disordered macromolecular counterion

Författare: Rajhans Sharma; Sriram Kesarimangalam; Erik D. Holmstrom; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2020

Publicerat i: Biochemical and Biophysical Research Communications

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Phosphorylated CtIP bridges DNA to promote annealing of broken ends

Författare: Robin Öz; Sean Howard; Rajhans Sharma; Hanna Törnkvist; Ilaria Ceppi; Sriram Kesarimangalam; Erik Kristiansson; Petr Cejka; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2020

Publicerat i: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Quantifying DNA damage induced by ionizing radiation and hyperthermia using single DNA molecule imaging

Författare: Vandana Singh; Pegah Johansson; Dmitry Torchinsky; Yii Lih Lin; Robin Öz; Y. Ebenstein; Ola Hammarsten; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2020

Publicerat i: Translational Oncology

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Molecular Epidemiology of OXA-48 and NDM-1 Producing Enterobacterales Species at a University Hospital in Tehran, Iran, Between 2015 and 2016

Författare: Hamid Solgi; Shoeib Nematzadeh; Christian G. Giske; Farzad Badmasti; Fredrik Westerlund; Yii Lih Lin; Gaurav Goyal; Vajihe Sadat Nikbin; Amir Hesam Nemati; Fereshteh Shahcheraghi

Publiceringsår: 2020

Publicerat i: Frontiers in Microbiology

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Cultivation-Free Typing of Bacteria Using Optical DNA Mapping

Författare: Vilhelm Müller; My Nyblom; Anna Johnning; Marie Wrande; Albertas Dvirnas; Sriram Kesarimangalam; Christian G. Giske; Tobias Ambjörnsson; L. Sandegren; Erik Kristiansson; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2020

Publicerat i: ACS Infectious Diseases

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Lipid vesicle composition influences the incorporation and fluorescence properties of the lipophilic sulphonated carbocyanine dye SP-DiO

Författare: Quentin Lubart; Jonas Hannestad; Hudson Pace; Daniel Fjällborg; Fredrik Westerlund; Elin Esbjörner Winters; Marta Bally

Publiceringsår: 2020

Publicerat i: Physical Chemistry Chemical Physics

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
A Nanofluidic Device for Multiplexed Analysis of Single Exosomes

Författare: Quentin Lubart; Sune Levin; Stephan Block; Silver Jõemetsa; Sriram Kesarimangalam; Fredrik Höök; Marta Bally; Fredrik Westerlund; Elin Esbjörner Winters

Publiceringsår: 2020

Publicerat i:

Publikationstyp: Övrigt konferensbidrag
Studying the Intramolecular Forces of Base-Modified Nucleic Acids using Optical Tweezers

Författare: Vinoth Sundar Rajan; Xavier Viader; Yii Lih Lin; Felix Ritort; Fredrik Westerlund; Marcus Wilhelmsson

Publiceringsår: 2020

Publicerat i:

Publikationstyp: Poster (konferens)
Effect of Chirality on the Elastic Properties of the DNA-Threading Binuclear Ruthenium Complex

Författare: Adam A. Jabak; Nicholas Bryden; Fredrik Westerlund; Per Lincoln; Micah J. McCauley; Ioulia F. Rouzina; Mark C. Williams; Thayaparan Paramanathan

Publiceringsår: 2020

Publicerat i: Biophysical Journal

Publikationstyp: Paper i proceeding
Identifying Evolutionarily Conserved Features of NHEJ from Prokaryotes to Eukaryotes using Single-Molecule Approaches

Författare: Robin Öz; Rajhans Sharma; Sriram Kesarimangalam; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2020

Publicerat i:

Publikationstyp: Övrigt konferensbidrag
Real-Time Condensation of Nanoconfined DNA by an Intrinsically Disordered Polycationic Protein

Författare: Rajhans Sharma; Sriram Kesarimangalam; Erik D. Holmstrom; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2020

Publicerat i: Biophysical Journal

Publikationstyp: Paper i proceeding
DNA Bridging by the Homologous Recombination Component CtIP Investigated on the Single DNA Molecule Level

Författare: Robin Öz; Sriram Kesarimangalam; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2020

Publicerat i:

Publikationstyp: Övrigt konferensbidrag
2019
Multiplexed optical DNA mapping to identify plasmids and their resistance genes in fecal samples

Författare: Sriram Kesarimangalam; Yii Lih Lin; Tsegaye Sewunet; Shoeib Nematzadeh; Christian G. Giske; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2019

Publicerat i: 23rd International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences, MicroTAS 2019

Publikationstyp: Paper i proceeding

Gå till Chalmers publikationsbibliotek

Projekt
2020-01-01 — 2022-12-31

Förbättrad cancerbehandling av barn känsliga för DNA-skador
2020-01-01 — 2022-12-31

Förbättrad diagnos av akut leukemi hos barn
2020-01-01 — 2022-12-31

Identifiering av bakteriella infektioner och antibiotikaresistens i låginkomstländer via "optical...
2021-01-01 — 2023-12-31

Identifying molecular mechanisms causing sensitivity to chemotherapy
2021-01-01 — 2024-12-31

Visualisering av DNA-Reparation - En Molekyl i Taget
2020-04-01 — 2025-03-31

nanoDNArepair
Avslutade
2017-08-01 — 2019-07-31

A novel ultrafast method for detecting multiresistant bacteria in intensive care units
2019-12-01 — 2020-09-30

Basal oxidative damage level assay (BODLA)
2017-01-01 — 2019-12-31

Bärbar diagnostik för sjukdom och antibiotikaresistans med fokus på malaria och bakterieinfektioner
2016-11-01 — 2018-04-30

Characterization of bacterial plasmids on a smartphone
2020-08-24 — 2021-05-17

Detection and characterization of chromosomal translocations in acute leukemia using optical DNA...
2012-01-01 — 2015-12-31

En nanofluidisk plattform för studier av biomolekyler på enkelmolekylnivå
2015-06-01 — 2019-12-31

Genomic diagnostics beyond the sequence (BeyondSeq)
2018-01-01 — 2020-12-31

Individanpassning av cancerbehandling med cellgifter genom direkt mätning av DNA-skador
2017-01-01 — 2019-12-31

Mätning av DNA-skador som ett sätt att individanpassa cancerbehandling med cellgifter
2014-01-01 — 2016-12-31

Nanofluidics for ultrafast diagnosis of bacterial infections (NanoDiaBac)
2015-01-01 — 2016-12-31

Odlingsfri identifiering av antibiotikaresistens
2018-04-01 — 2020-12-31

Plasmididentifikation och -detektion i Sydostasien - Enterobacteriaceae resistenta mot sista...
2016-07-01 — 2018-12-31

Studier av DNA-reparation på enskilda DNA-molekyler

Sidansvarig Publicerad: ti 01 sep 2020.

Fredrik Westerlund

Senaste publikationer

2021

2020

2019

Projekt

Avslutade