Fredrik Westerlund

Bitr. professor; Biologi och Bioteknik
Avdelningschef för Kemisk Biologi

fredrik.westerlund@chalmers.se +46 31 772 30 49 Hitta till mig http://orcid.org/0000-0002-4767-4868

Fredrik Westerlunds forskargrupp studerar enstaka DNA-molekyler in nanokanaler med hjälp av fluorescensmikroskopi. Fokus ligger både på att utveckla nya metoder för att kartlägga DNA sekvenser så väl som att studera DNA-proteininteraktioner.

Westerlunds Forskningsgrupp

Publikationer - ResearcherID

Undervisning
Publikationer
Samverkan och projekt

Biofysikalisk kemi (KFK021), Föreläsare

Utvalda publikationer
Single Particle Nanoplasmonic Sensing in Individual Nanofluidic Channels

Författare: Joachim Fritzsche; David Albinsson; Michael Fritzsche; Tomasz Antosiewicz; Fredrik Westerlund; Christoph Langhammer

Publiceringsår: 2016

Publicerat i: Nano Letters

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
DNA compaction by the bacteriophage protein Cox studied on the single DNA molecule level using nanofluidic channels

Författare: Karolin Frykholm; Ronnie Berntsson; M. Claesson; Laura De Battice; R. Odegrip; P. Stenmark; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2016

Publicerat i: Nucleic Acids Research

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Direct identification of antibiotic resistance genes on single plasmid molecules using CRISPR/Cas9 in combination with optical DNA mapping.

Författare: Vilhelm Müller; Fredrika Rajer; Karolin Frykholm; Lena Nyberg; Mahmood Saair Quaderi; Joachim Fritzsche; Erik Kristiansson; T. Ambjornsson; L. Sandegren; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2016

Publicerat i: Scientific Reports

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Senaste publikationer

2020
Identifying Evolutionarily Conserved Features of NHEJ from Prokaryotes to Eukaryotes using Single-Molecule Approaches

Författare: Robin Öz; Rajhans Sharma; Sriram Kesarimangalam; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2020

Publicerat i: Biophysical Journal

Publikationstyp: Paper i proceeding
Real-Time Condensation of Nanoconfined DNA by an Intrinsically Disordered Polycationic Protein

Författare: Rajhans Sharma; Sriram Kesarimangalam; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2020

Publicerat i: Biophysical Journal

Publikationstyp: Paper i proceeding
DNA Bridging by the Homologous Recombination Component CtIP Investigated on the Single DNA Molecule Level

Författare: Robin Öz; Sriram Kesarimangalam; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2020

Publicerat i: Biophysical Journal

Publikationstyp: Paper i proceeding
2019
A nanofluidic device for parallel single nanoparticle catalysis in solution

Författare: Sune Levin; Joachim Fritzsche; Sara Nilsson; August Runemark; Bhausaheb Kashinath Dhokale; Henrik Ström; Henrik Sundén; Christoph Langhammer; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2019

Publicerat i: Nature Communications

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Optical DNA Mapping Combined with Cas9-Targeted Resistance Gene Identification for Rapid Tracking of Resistance Plasmids in a Neonatal Intensive Care Unit Outbreak

Författare: Santosh Kumar Bikarolla; Viveka Nordberg; Fredrika Rajer; Vilhelm Müller; Muhammad Humaun Kabir; Sriram Kesarimangalam; Albertas Dvirnas; Tobias Ambjornsson; Christian G. Giske; Lars Navér; Linus Sandegren; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2019

Publicerat i: mBio

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Enzyme-free optical DNA mapping of the human genome using competitive binding

Författare: Vilhelm Müller; Albertas Dvirnas; John Andersson; Vandana Singh; Sriram Kesarimangalam; Pegah Johansson; Y. Ebenstein; Tobias Ambjornsson; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2019

Publicerat i: Nucleic Acids Research

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Alpha-Synuclein Binds to DNA and Modulates its Physical Properties

Författare: Kai Jiang; Sandra Rocha; Alvina Westling; Sriram Kesarimangalam; Kevin D. Dorfman; Pernilla Wittung Stafshede; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2019

Publicerat i: Biophysical Journal

Publikationstyp: Paper i proceeding
Annealing of ssDNA and compaction of dsDNA by the HIV-1 nucleocapsid and Gag proteins visualized using nanofluidic channels

Författare: Kai Jiang; Nicolas Humbert; Sriram Kesarimangalam; Thiebault Lequeu; Yii Lih Lin; Yves Mely; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2019

Publicerat i: Quarterly Reviews of Biophysics

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
A nanofluidic device for real-time visualization of DNA-protein interactions on the single DNA molecule level

Författare: Robin Öz; Sriram Kesarimangalam; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2019

Publicerat i: Nanoscale

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Interspecies plasmid transfer appears rare in sequential infections with extended-spectrum β-lactamase (ESBL)-producing Enterobacteriaceae

Författare: Anna Lindblom; Sriram Kesarimangalam; Vilhelm Müller; Robin Öz; Hilda Sandström; Christina M. Åhrén; Fredrik Westerlund; Nahid Karami

Publiceringsår: 2019

Publicerat i: Diagnostic Microbiology and Infectious Disease

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
A nanofluidic device for real-time visualization of DNA-protein interactions on the single DNA molecule level

Författare: Robin Öz; Sriram Kk; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2019

Publicerat i: Nanoscale

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Genetic variation in the conjugative plasmidome of a hospital effluent multidrug resistant Escherichia coli strain

Författare: Catarina Ferreira; D. Bogas; Santosh K. Bikarolla; Ana Rita Varela; Karolin Frykholm; Raquel Linheiro; O. C. Nunes; Fredrik Westerlund; C. M. Manaia

Publiceringsår: 2019

Publicerat i: Chemosphere

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
2018
Nanofluidic optical DNA mapping for rapid identification of antibiotics resistant plasmids

Författare: Yii Lih Lin; Tsegaye Sewunet; Sriram Kesarimangalam; Christian G. Giske; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2018

Publicerat i: 22nd International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences, MicroTAS 2018

Publikationstyp: Paper i proceeding
A Nanofluidic Device for Real-Time Visualization of DNA-Protein Interactions on the Single DNA Molecule Level

Författare: Robin Öz; Sriram Kesarimangalam; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2018

Publicerat i: Biophysical Journal

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
The resistomes of six carbapenem-resistant pathogens - a critical genotype-phenotype analysis

Författare: Anna Johnning; N. Karami; Erika Tång Hallbäck; Vilhelm Müller; Lena Nyberg; Mariana Buongermino Pereira; Callum L. Stewart; Tobias Ambjörnsson; Fredrik Westerlund; Ingegerd Adlerberth; Erik Kristiansson

Publiceringsår: 2018

Publicerat i: Microbial Genomics

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Stochastic unfolding of nanoconfined DNA: Experiments, model and Bayesian analysis

Författare: Jens Krog; Mohammadreza Alizadehheidari; Erik Werner; Santosh Kumar Bikarolla; Jonas O. Tegenfeldt; Bernhard Mehlig; Michael A. Lomholt; Fredrik Westerlund; Tobias Ambjornsson

Publiceringsår: 2018

Publicerat i: Journal of Chemical Physics

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Alpha-Synuclein Modulates the Physical Properties of DNA

Författare: Kai Jiang; Sandra Rocha; Alvina Westling; Sriram Kesarimangalam; Kevin D. Dorfman; Pernilla Wittung Stafshede; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2018

Publicerat i: Chemistry - A European Journal

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Bacterial response to graphene oxide and reduced graphene oxide integrated in agar plates

Författare: Venkata Raghavendra Subrahmanya Sar Mokkapati; Santosh Pandit; JinHo Kim; Anders Mårtensson; Martin Lovmar; Fredrik Westerlund; Ivan Mijakovic

Publiceringsår: 2018

Publicerat i: Royal Society Open Science

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Hairpins in the conformations of a confined polymer

Författare: E. Werner; A. Jain; A. Muralidhar; Karolin Frykholm; T. St Clere Smithe; Joachim Fritzsche; Fredrik Westerlund; K. D. Dorfman; B. Mehlig

Publiceringsår: 2018

Publicerat i: Biomicrofluidics

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Vertically Aligned Graphene Coating is Bactericidal and Prevents the Formation of Bacterial Biofilms

Författare: Santosh Pandit; Z. Cao; Venkata Raghu Mokkapati; Emanuele Celauro; Avgust Yurgens; Martin Lovmar; Fredrik Westerlund; Jie Sun; Ivan Mijakovic

Publiceringsår: 2018

Publicerat i: Advanced Materials Interfaces

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Reshaping the Energy Landscape Transforms the Mechanism and Binding Kinetics of DNA Threading Intercalation

Författare: Andrew G. Clark; M. Nabuan Naufer; Fredrik Westerlund; Per Lincoln; I. Rouzina; T. Paramanathan; Mark C. Williams

Publiceringsår: 2018

Publicerat i: Biochemistry

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Fluorescence microscopy of nanochannel-confined DNA

Författare: Fredrik Westerlund; F. Persson; Joachim Fritzsche; J. P. Beech; J. O. Tegenfeldt

Publiceringsår: 2018

Publicerat i: Methods in Molecular Biology

Publikationstyp: Kapitel i bok

Gå till Chalmers publikationsbibliotek

Projekt
2019-12-01 — 2020-09-30

Basal oxidative damage level assay (BODLA)
2020-01-01 — 2022-12-31

Förbättrad diagnos av akut leukemi hos barn
2018-01-01 — 2020-12-31

Individanpassning av cancerbehandling med cellgifter genom direkt mätning av DNA-skador
2018-04-01 — 2020-12-31

Plasmididentifikation och -detektion i Sydostasien - Enterobacteriaceae resistenta mot sista...
2020-04-01 — 2025-03-31

nanoDNArepair
Avslutade
2017-08-01 — 2019-07-31

A novel ultrafast method for detecting multiresistant bacteria in intensive care units
2017-01-01 — 2019-12-31

Bärbar diagnostik för sjukdom och antibiotikaresistans med fokus på malaria och bakterieinfektioner
2016-11-01 — 2018-04-30

Characterization of bacterial plasmids on a smartphone
2012-01-01 — 2015-12-31

En nanofluidisk plattform för studier av biomolekyler på enkelmolekylnivå
2015-06-01 — 2019-12-31

Genomic diagnostics beyond the sequence (BeyondSeq)
2017-01-01 — 2019-12-31

Mätning av DNA-skador som ett sätt att individanpassa cancerbehandling med cellgifter
2014-01-01 — 2016-12-31

Nanofluidics for ultrafast diagnosis of bacterial infections (NanoDiaBac)
2015-01-01 — 2016-12-31

Odlingsfri identifiering av antibiotikaresistens
2016-07-01 — 2018-12-31

Studier av DNA-reparation på enskilda DNA-molekyler

Publicerad: to 07 mar 2019.

Fredrik Westerlund

Utvalda publikationer

Senaste publikationer

2020

2019

2018

Projekt

Avslutade