Fredrik Westerlund

Bitr. professor; Biologi och Bioteknik
Avdelningschef för Kemisk Biologi

fredrik.westerlund@chalmers.se +46317723049 Hitta till mig http://orcid.org/0000-0002-4767-4868

Fredrik Westerlunds forskargrupp studerar enstaka DNA-molekyler in nanokanaler med hjälp av fluorescensmikroskopi. Fokus ligger både på att utveckla nya metoder för att kartlägga DNA sekvenser så väl som att studera DNA-proteininteraktioner.

Westerlunds Forskningsgrupp

Publikationer - ResearcherID

Undervisning
Publikationer
Samverkan och projekt

Biofysikalisk kemi (KFK021), Föreläsare

Senaste publikationer

2021
Single Molecule Experiments Define the Role of Nbs1 and Xrs2 in DNA Tethering by MRN and MRX in DSB Repair

Författare: Carl Ivar Möller; Rajhans Sharma; Robin Öz; Giordano Reginato; Elda Cannavo; Sriram Kesarimangalam; Petr Cejka; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2021

Publicerat i:

Publikationstyp: Övrigt konferensbidrag
Dynamics of Ku and bacterial non-homologous end-joining characterized using single DNA molecule analysis

Författare: Robin Öz; Jing L. Wang; Raphael Guerois; Gaurav Goyal; Sriram Kesarimangalam; Virginie Ropars; Rajhans Sharma; Firat Koca; Jean Baptiste Charbonnier; M. Modesti; Terence R. Strick; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2021

Publicerat i: Nucleic Acids Research

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Polyphasic characterization of carbapenemresistant Klebsiella pneumoniae clinical isolates suggests vertical transmission of the blaKPC-3gene

Författare: Catarina Ferreira; Santosh Kumar Bikarolla; Karolin Frykholm; Saga Pohjanen; Margarida Brito; Catarina Lameiras; O. C. Nunes; Fredrik Westerlund; C. M. Manaia

Publiceringsår: 2021

Publicerat i: PLoS ONE

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
2020
Stabilization of G-quadruplex DNA structures in Schizosaccharomyces pombe causes single-strand DNA lesions and impedes DNA replication

Författare: Ikenna Obi; Matilda Rentoft; Vandana Singh; Jan Jamroskovic; Karam Chand; E. Chorell; Fredrik Westerlund; Nasim Sabouri

Publiceringsår: 2020

Publicerat i: Nucleic Acids Research

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Optical maps of plasmids as a proxy for clonal spread of MDR bacteria: A case study of an outbreak in a rural Ethiopian hospital

Författare: Yii Lih Lin; Tsegaye Sewunet; Sriram Kesarimangalam; Christian G. Giske; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2020

Publicerat i: Journal of Antimicrobial Chemotherapy

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Real-time compaction of nanoconfined DNA by an intrinsically disordered macromolecular counterion

Författare: Rajhans Sharma; Sriram Kesarimangalam; Erik D. Holmstrom; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2020

Publicerat i: Biochemical and Biophysical Research Communications

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Phosphorylated CtIP bridges DNA to promote annealing of broken ends

Författare: Robin Öz; Sean Howard; Rajhans Sharma; Hanna Törnkvist; Ilaria Ceppi; Sriram Kesarimangalam; Erik Kristiansson; Petr Cejka; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2020

Publicerat i: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Quantifying DNA damage induced by ionizing radiation and hyperthermia using single DNA molecule imaging

Författare: Vandana Singh; Pegah Johansson; Dmitry Torchinsky; Yii Lih Lin; Robin Öz; Y. Ebenstein; Ola Hammarsten; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2020

Publicerat i: Translational Oncology

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Molecular Epidemiology of OXA-48 and NDM-1 Producing Enterobacterales Species at a University Hospital in Tehran, Iran, Between 2015 and 2016

Författare: Hamid Solgi; Shoeib Nematzadeh; Christian G. Giske; Farzad Badmasti; Fredrik Westerlund; Yii Lih Lin; Gaurav Goyal; Vajihe Sadat Nikbin; Amir Hesam Nemati; Fereshteh Shahcheraghi

Publiceringsår: 2020

Publicerat i: Frontiers in Microbiology

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Cultivation-Free Typing of Bacteria Using Optical DNA Mapping

Författare: Vilhelm Müller; My Nyblom; Anna Johnning; Marie Wrande; Albertas Dvirnas; Sriram Kesarimangalam; Christian G. Giske; Tobias Ambjörnsson; L. Sandegren; Erik Kristiansson; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2020

Publicerat i: ACS Infectious Diseases

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Lipid vesicle composition influences the incorporation and fluorescence properties of the lipophilic sulphonated carbocyanine dye SP-DiO

Författare: Quentin Lubart; Jonas Hannestad; Hudson Pace; Daniel Fjällborg; Fredrik Westerlund; Elin Esbjörner Winters; Marta Bally

Publiceringsår: 2020

Publicerat i: Physical Chemistry Chemical Physics

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
A Nanofluidic Device for Multiplexed Analysis of Single Exosomes

Författare: Quentin Lubart; Sune Levin; Stephan Block; Silver Jõemetsa; Sriram Kesarimangalam; Fredrik Höök; Marta Bally; Fredrik Westerlund; Elin Esbjörner Winters

Publiceringsår: 2020

Publicerat i:

Publikationstyp: Övrigt konferensbidrag
Studying the Intramolecular Forces of Base-Modified Nucleic Acids using Optical Tweezers

Författare: Vinoth Sundar Rajan; Xavier Viader; Yii Lih Lin; Felix Ritort; Fredrik Westerlund; Marcus Wilhelmsson

Publiceringsår: 2020

Publicerat i:

Publikationstyp: Poster (konferens)
Effect of Chirality on the Elastic Properties of the DNA-Threading Binuclear Ruthenium Complex

Författare: Adam A. Jabak; Nicholas Bryden; Fredrik Westerlund; Per Lincoln; Micah J. McCauley; Ioulia F. Rouzina; Mark C. Williams; Thayaparan Paramanathan

Publiceringsår: 2020

Publicerat i: Biophysical Journal

Publikationstyp: Paper i proceeding
Identifying Evolutionarily Conserved Features of NHEJ from Prokaryotes to Eukaryotes using Single-Molecule Approaches

Författare: Robin Öz; Rajhans Sharma; Sriram Kesarimangalam; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2020

Publicerat i:

Publikationstyp: Övrigt konferensbidrag
Real-Time Condensation of Nanoconfined DNA by an Intrinsically Disordered Polycationic Protein

Författare: Rajhans Sharma; Sriram Kesarimangalam; Erik D. Holmstrom; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2020

Publicerat i: Biophysical Journal

Publikationstyp: Paper i proceeding
DNA Bridging by the Homologous Recombination Component CtIP Investigated on the Single DNA Molecule Level

Författare: Robin Öz; Sriram Kesarimangalam; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2020

Publicerat i:

Publikationstyp: Övrigt konferensbidrag
2019
Bacterial identification by optical mapping of genomic DNA in nanofluidic channels

Författare: My Nyblom; Vilhelm Müller; Anna Johnning; Marie Wrande; Albertas Dvirnas; Sriram Kesarimangalam; Christian G. Giske; Tobias Ambjörnsson; L. Sandegren; Erik Kristiansson; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2019

Publicerat i: 23rd International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences, MicroTAS 2019

Publikationstyp: Paper i proceeding
Optical DNA mapping using nanochannels for identification of plasmids carrying carbapenemase blandm-1 gene from patients admitted to a Vietnamese hospital

Författare: Sriram Kesarimangalam; Maud Nilsson; Björn Berglund; Linus Olson; Hoang Bich Ngoc; Tran Minh Dien; Mattias Larsson; Håkan Hanberger; Christian G. Giske; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2019

Publicerat i: 23rd International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences, MicroTAS 2019

Publikationstyp: Paper i proceeding
Multiplexed optical DNA mapping to identify plasmids and their resistance genes in fecal samples

Författare: Sriram Kesarimangalam; Yii Lih Lin; Tsegaye Sewunet; Shoeib Nematzadeh; Christian G. Giske; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2019

Publicerat i: 23rd International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences, MicroTAS 2019

Publikationstyp: Paper i proceeding
A nanofluidic device for parallel single nanoparticle catalysis in solution

Författare: Sune Levin; Joachim Fritzsche; Sara Nilsson; August Runemark; Bhausaheb Kashinath Dhokale; Henrik Ström; Henrik Sundén; Christoph Langhammer; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2019

Publicerat i: Nature Communications

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Optical DNA Mapping Combined with Cas9-Targeted Resistance Gene Identification for Rapid Tracking of Resistance Plasmids in a Neonatal Intensive Care Unit Outbreak

Författare: Santosh Kumar Bikarolla; Viveka Nordberg; Fredrika Rajer; Vilhelm Müller; Muhammad Humaun Kabir; Sriram Kesarimangalam; Albertas Dvirnas; Tobias Ambjornsson; Christian G. Giske; Lars Navér; Linus Sandegren; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2019

Publicerat i: mBio

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Alpha-Synuclein Binds to DNA and Modulates its Physical Properties

Författare: Kai Jiang; Sandra Rocha; Alvina Westling; Sriram Kesarimangalam; Kevin D. Dorfman; Pernilla Wittung Stafshede; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2019

Publicerat i: Biophysical Journal

Publikationstyp: Paper i proceeding
A nanofluidic device for real-time visualization of DNA–protein interactions on the single DNA molecule level

Författare: Robin Öz; Sriram Kesarimangalam; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2019

Publicerat i: Nanoscale

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Genetic variation in the conjugative plasmidome of a hospital effluent multidrug resistant Escherichia coli strain

Författare: Catarina Ferreira; D. Bogas; Santosh K. Bikarolla; Ana Rita Varela; Karolin Frykholm; Raquel Linheiro; O. C. Nunes; Fredrik Westerlund; C. M. Manaia

Publiceringsår: 2019

Publicerat i: Chemosphere

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift

Gå till Chalmers publikationsbibliotek

Projekt
2020-01-01 — 2022-12-31

Förbättrad cancerbehandling av barn känsliga för DNA-skador
2020-01-01 — 2022-12-31

Förbättrad diagnos av akut leukemi hos barn
2020-01-01 — 2022-12-31

Identifiering av bakteriella infektioner och antibiotikaresistens i låginkomstländer via "optical...
2021-01-01 — 2024-12-31

Visualisering av DNA-Reparation - En Molekyl i Taget
2020-04-01 — 2025-03-31

nanoDNArepair
Avslutade
2017-08-01 — 2019-07-31

A novel ultrafast method for detecting multiresistant bacteria in intensive care units
2019-12-01 — 2020-09-30

Basal oxidative damage level assay (BODLA)
2017-01-01 — 2019-12-31

Bärbar diagnostik för sjukdom och antibiotikaresistans med fokus på malaria och bakterieinfektioner
2016-11-01 — 2018-04-30

Characterization of bacterial plasmids on a smartphone
2020-08-24 — 2021-05-17

Detection and characterization of chromosomal translocations in acute leukemia using optical DNA...
2012-01-01 — 2015-12-31

En nanofluidisk plattform för studier av biomolekyler på enkelmolekylnivå
2015-06-01 — 2019-12-31

Genomic diagnostics beyond the sequence (BeyondSeq)
2018-01-01 — 2020-12-31

Individanpassning av cancerbehandling med cellgifter genom direkt mätning av DNA-skador
2017-01-01 — 2019-12-31

Mätning av DNA-skador som ett sätt att individanpassa cancerbehandling med cellgifter
2014-01-01 — 2016-12-31

Nanofluidics for ultrafast diagnosis of bacterial infections (NanoDiaBac)
2015-01-01 — 2016-12-31

Odlingsfri identifiering av antibiotikaresistens
2018-04-01 — 2020-12-31

Plasmididentifikation och -detektion i Sydostasien - Enterobacteriaceae resistenta mot sista...
2016-07-01 — 2018-12-31

Studier av DNA-reparation på enskilda DNA-molekyler

Sidansvarig Publicerad: ti 01 sep 2020.

Fredrik Westerlund

Senaste publikationer

2021

2020

2019

Projekt

Avslutade