Hoppa över menyflikskommandon

Hoppa till huvudinnehåll

Start

Eduard Kerkhoven

Personal

Eduard Kerkhoven

Projektledare

eduardk@chalmers.se Hitta till mig http://orcid.org/0000-0002-3593-5792

Eduard tillhör gruppen systembiologi. Se den engelska sidan för mer information.

Publikationer
Samverkan och projekt

Senaste publikationer

2022
Generation and analysis of context-specific genome-scale metabolic models derived from single-cell RNA-Seq data

Författare: Johan Gustafsson; Jonathan Robinson; Fariba Roshanzamir; Rebecka Jörnsten; Eduard Kerkhoven; Jens B Nielsen

Publiceringsår: 2022

Publicerat i:

Publikationstyp: Preprint
Genome-scale metabolic model of oleaginous yeast Papiliotrema laurentii

Författare: Rafaela Zandonade Ventorim; Maurício Alexander de Moura Ferreira; Eduardo Luís Menezes de Almeida; Eduard Kerkhoven; Wendel Batista da Silveira

Publiceringsår: 2022

Publicerat i: Biochemical Engineering Journal

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Multiscale models quantifying yeast physiology: towards a whole-cell model

Författare: Hongzhong Lu; Eduard Kerkhoven; Jens B Nielsen

Publiceringsår: 2022

Publicerat i: Trends in Biotechnology

Publikationstyp: Reviewartikel
2021
Adaptations in metabolism and protein translation give rise to the Crabtree effect in yeast

Författare: Carl Malina; Rosemary Brown; Johan Björkeroth; Eduard Kerkhoven; Jens B Nielsen

Publiceringsår: 2021

Publicerat i: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Editorial: Multi-Omics Technologies for Optimizing Synthetic Biomanufacturing

Författare: Young Mo Kim; Christopher J. Petzold; Eduard Kerkhoven; S. E. Baker

Publiceringsår: 2021

Publicerat i: Frontiers in Bioengineering and Biotechnology

Publikationstyp: Övrig text i vetenskaplig tidskrift
Constraint-based modeling of yeast mitochondria reveals the dynamics of protein import and iron-sulfur cluster biogenesis

Författare: Carl Malina; Francesca Di Bartolomeo; Eduard Kerkhoven; Jens B Nielsen

Publiceringsår: 2021

Publicerat i: ISCIENCE

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Yeast metabolic innovations emerged via expanded metabolic network and gene positive selection

Författare: Hongzhong Lu; Feiran Li; Le Yuan; Iván Domenzain Del Castillo Cerecer; Rosemary Yu; Hao Wang; Gang Li; Yu Chen; Boyang Ji; Eduard Kerkhoven; Jens B Nielsen

Publiceringsår: 2021

Publicerat i: Molecular Systems Biology

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
The yeastGemMap: A process diagram to assist yeast systems-metabolic studies

Författare: Luis Caspeta-Guadarrama; Eduard Kerkhoven; Alfredo Martinez; Jens B Nielsen

Publiceringsår: 2021

Publicerat i: Biotechnology and Bioengineering

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Systems-level approaches for understanding and engineering of the oleaginous cell factory Yarrowia lipolytica

Författare: Naghmeh Poorinmohammad; Eduard Kerkhoven

Publiceringsår: 2021

Publicerat i: Biotechnology and Bioengineering

Publikationstyp: Reviewartikel
Reconstruction of a Genome-Scale Metabolic Model of Streptomyces albus J1074: Improved Engineering Strategies in Natural Product Synthesis

Författare: Cheewin Kittikunapong; Suhui Ye; Patricia Magadan-Corpas; Alvaro Perez-Valero; Claudio J. Villar; Felipe Lombo; Eduard Kerkhoven

Publiceringsår: 2021

Publicerat i: Metabolites

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Evaluating accessibility, usability and interoperability of genome-scale metabolic models for diverse yeasts species

Författare: Iván Domenzain Del Castillo Cerecer; Feiran Li; Eduard Kerkhoven; Verena Siewers

Publiceringsår: 2021

Publicerat i: FEMS Yeast Research

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
2020
Enzyme-Constrained Models and Omics Analysis of Streptomyces coelicolor Reveal Metabolic Changes that Enhance Heterologous Production

Författare: Snorre Sulheim; Tjaša Kumelj; Dino van Dissel; Ali Salehzadeh-Yazdi; Chao Du; Gilles P. van Wezel; Kay Nieselt; Eivind Almaas; Alexander Wentzel; Eduard Kerkhoven; Eduard J. Kerkhoven

Publiceringsår: 2020

Publicerat i: iScience

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Nitrogen as the major factor influencing gene expression in Yarrowia lipolytica

Författare: Piotr Hapeta; Eduard Kerkhoven; Zbigniew Lazar

Publiceringsår: 2020

Publicerat i: Biotechnology Reports

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
An atlas of human metabolism

Författare: Jonathan Robinson; Pinar Kocabas; Hao Wang; Pierre-Etienne Cholley; Daniel John Cook; Avlant Nilsson; Petre Mihail Anton; Raphael Ferreira; Iván Domenzain Del Castillo Cerecer; Virinchi Billa; Angelo Limeta; Alex Hedin; Johan Gustafsson; Eduard Kerkhoven; Thomas Svensson; Bernhard O. Palsson; Adil Mardinoglu; Lena Hansson; Mathias Uhlen; Jens B Nielsen

Publiceringsår: 2020

Publicerat i: Science signaling

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Extracting novel hypotheses and findings from RNA-seq data

Författare: Tyler Doughty; Eduard Kerkhoven

Publiceringsår: 2020

Publicerat i: FEMS Yeast Research

Publikationstyp: Reviewartikel
C/N ratio and carbon source-dependent lipid production profiling in Rhodotorula toruloides

Författare: Helberth Júnnior Santos Lopes; Nemailla Bonturi; Eduard Kerkhoven; Everson Alves Miranda; Petri-Jaan Lahtvee

Publiceringsår: 2020

Publicerat i: Applied Microbiology and Biotechnology

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
2019
Investigating the Influence of Glycerol on the Utilization of Glucose in Yarrowia lipolytica Using RNA-Seq-Based Transcriptomics

Författare: Patrice Lubuta; M. Workman; Eduard Kerkhoven; C. T. Workman

Publiceringsår: 2019

Publicerat i: G3: Genes, Genomes, Genetics

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Genome-scale model of Rhodotorula toruloides metabolism

Författare: Ievgeniia Tiukova; Sylvain Prigent; Jens B Nielsen; Mats Sandgren; Eduard Kerkhoven

Publiceringsår: 2019

Publicerat i: Biotechnology and Bioengineering

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
A consensus S. cerevisiae metabolic model Yeast8 and its ecosystem for comprehensively probing cellular metabolism

Författare: Hongzhong Lu; Feiran Li; Benjamín José Sánchez; Zhengming Zhu; Gang Li; Iván Domenzain Del Castillo Cerecer; Simonas Marcisauskas; Petre Mihail Anton; Dimitra Lappa; Christian Lieven; Moritz Emanuel Beber; N. Sonnenschein; Eduard Kerkhoven; Jens B Nielsen

Publiceringsår: 2019

Publicerat i: Nature Communications

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Proteome analysis of xylose metabolism in Rhodotorula toruloides during lipid production

Författare: Ievgeniia Tiukova; Jule Brandenburg; Johanna Blomqvist; Sabine Sampels; Nils Mikkelsen; Morten Skaugen; Magnus Arntzen; Jens B Nielsen; Mats Sandgren; Eduard Kerkhoven

Publiceringsår: 2019

Publicerat i: Biotechnology for Biofuels

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Mapping the metabolism of five amino acids in bloodstream form Trypanosoma brucei using U- 13C-labelled substrates and LC–MS

Författare: Katharina Johnston; D. H. Kim; Eduard Kerkhoven; R. J. Burchmore; M. P. Barrett; F. Achcar

Publiceringsår: 2019

Publicerat i: Bioscience Reports

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
SLIMEr: Probing flexibility of lipid metabolism in yeast with an improved constraint-based modeling framework

Författare: Benjamín José Sánchez; Feiran Li; Eduard Kerkhoven; Jens B Nielsen

Publiceringsår: 2019

Publicerat i: BMC Systems Biology

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
2018
Regulation of yeast-to-hyphae transition in Yarrowia lipolytica

Författare: Kyle R. Pomraning; Erin L. Bredeweg; Eduard Kerkhoven; Kerrie Barry; Sajeet Haridas; Hope Hundley; Kurt LaButti; Anna Lipzen; Mi Yan; J. K. Magnuson; Blake A. Simmons; I. V. Grigoriev; Jens B Nielsen; S. E. Baker

Publiceringsår: 2018

Publicerat i: mSphere

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Barriers and opportunities in bio-based production of hydrocarbons

Författare: Yongjin Zhou; Eduard Kerkhoven; Jens B Nielsen

Publiceringsår: 2018

Publicerat i: Nature Energy

Publikationstyp: Reviewartikel
RAVEN 2.0: A versatile toolbox for metabolic network reconstruction and a case study on Streptomyces coelicolor

Författare: Hao Wang; Simonas Marcisauskas; Benjamin José Sanchez Barja; Iván Domenzain Del Castillo Cerecer; Daniel Hermansson; Rasmus Ågren; Jens B Nielsen; Eduard Kerkhoven

Publiceringsår: 2018

Publicerat i: PLoS Computational Biology

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift

Gå till Chalmers publikationsbibliotek

Sidansvarig Publicerad: fr 03 mar 2017.