Erik Kristiansson

Professor, Matematiska vetenskaper

erik.kristiansson@chalmers.se +46 31 772 35 21 Hitta till mig

My research focuses on analysis of quantitative data with applications in molecular biology and medicine.

More information about me and my research group is available at http://bioinformatics.math.chalmers.se/erikkristiansson/erikkristiansson.html

Undervisning
Publikationer
Samverkan och projekt

TMS145, MVE350, MVE405

Senaste publikationer

2019
Sewage effluent from an Indian hospital harbors novel carbapenemases and integron-borne antibiotic resistance genes

Författare: Nachiket Marathe; Fanny Berglund; Mohammad Razavi; C. Pal; Johannes Dröge; Sharvari Samant; Erik Kristiansson; D. G. Joakim Larsson

Publiceringsår: 2019

Publicerat i: Microbiome

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
CMY-1/MOX-family AmpC β-lactamases MOX-1, MOX-2 and MOX-9 were mobilized independently from three Aeromonas species

Författare: Stefan Ebmeyer; Erik Kristiansson; D. G. Joakim Larsson

Publiceringsår: 2019

Publicerat i: Journal of Antimicrobial Chemotherapy

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Modelling of zero-inflation improves inference of metagenomic gene count data

Författare: Viktor Jonsson; Tobias Österlund; Olle Nerman; Erik Kristiansson

Publiceringsår: 2019

Publicerat i: Statistical Methods in Medical Research

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Pharmacology beyond the patient – The environmental risks of human drugs

Författare: Lina-Maria Gunnarsson; Jason R. Snape; Bas Verbruggen; Stewart F. Owen; Erik Kristiansson; Luigi Margiotta-Casaluci; Tobias Österlund; Kathryn Hutchinson; Dean Leverett; Becky Marks; C. R. Tyler

Publiceringsår: 2019

Publicerat i: Environment International

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Accurate and Sensitive Analysis of Minimal Residual Disease in Acute Myeloid Leukemia Using Deep Sequencing of Single Nucleotide Variations

Författare: Erik Delsing Malmberg; Anna Rehammar; Mariana Buongermino Pereira; Jonas Abrahamsson; Tore Samuelsson; Sara Stahlman; Julia Asp; Anne Tierens; Lars Palmqvist; Erik Kristiansson; Linda Fogelstrand

Publiceringsår: 2019

Publicerat i: Journal of Molecular Diagnostics

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Identification and reconstruction of novel antibiotic resistance genes from metagenomes

Författare: Fanny Berglund; Tobias Österlund; Fredrik Boulund; Nachiket P. Marathe; D. G. Joakim Larsson; Erik Kristiansson

Publiceringsår: 2019

Publicerat i: Microbiome

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
177 Lu-octreotate therapy for neuroendocrine tumours is enhanced by Hsp90 inhibition

Författare: Tobias Hofving; Viktor Sandblom; Yvonne Arvidsson; Emman Shubbar; Gulay Altiparmak; John Swanpalmer; Bilal Almobarak; Anna-Karin Elf; Viktor Johanson; Erik Elias; Erik Kristiansson; Eva Forssell-Aronsson; Ola Nilsson

Publiceringsår: 2019

Publicerat i: Endocrine-Related Cancer

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
2018
The resistomes of six carbapenem-resistant pathogens - a critical genotype-phenotype analysis

Författare: Anna Johnning; N. Karami; Erika Tång Hallbäck; Vilhelm Müller; Lena Nyberg; Mariana Buongermino Pereira; Callum L. Stewart; Tobias Ambjörnsson; Fredrik Westerlund; Ingegerd Adlerberth; Erik Kristiansson

Publiceringsår: 2018

Publicerat i: Microbial Genomics

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Proteotyping bacteria: Characterization, differentiation and identification of pneumococcus and other species within the Mitis Group of the genus Streptococcus by tandem mass spectrometry proteomics

Författare: Roger Karlsson; Lucia Gonzales-Siles; Margarita Gomila; Antonio Busquets; Francisco Salva-Serra; Daniel Jaen-Luchoro; Hedvig E. Jakobsson; Anders Karlsson; Fredrik Boulund; Erik Kristiansson; Edward R. B. Moore

Publiceringsår: 2018

Publicerat i: PLoS ONE

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
miRNA profiling of small intestinal neuroendocrine tumors defines novel molecular subtypes and identifies miR-375 as a biomarker of patient survival

Författare: Yvonne Arvidsson; Anna Rehammar; Anders Bergström; Ellinor Andersson; Gülay Altiparmak; Christina Swärd; Bo Wängberg; Erik Kristiansson; Ola Nilsson

Publiceringsår: 2018

Publicerat i: Modern Pathology

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Comparison of normalization methods for the analysis of metagenomic gene abundance data

Författare: Mariana Buongermino Pereira; Mikael Wallroth; Viktor Jonsson; Erik Kristiansson

Publiceringsår: 2018

Publicerat i: BMC Genomics

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Selective concentration for ciprofloxacin resistance in Escherichia coli grown in complex aquatic bacterial biofilms

Författare: Nadine Kraupner; Stefan Ebmeyer; Johan Bengtsson-Palme; Jerker Fick; Erik Kristiansson; Carl-Fredrik Flach; D. G. Joakim Larsson

Publiceringsår: 2018

Publicerat i: Environment International

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Environmental factors influencing the development and spread of antibiotic resistance

Författare: Johan Bengtsson-Palme; Erik Kristiansson; D. G. Joakim Larsson

Publiceringsår: 2018

Publicerat i: FEMS Microbiology Reviews

Publikationstyp: Reviewartikel
Facilitated sequence assembly using densely labeled optical DNA barcodes: A combinatorial auction approach

Författare: Albertas Dvirnas; C. Pichler; Callum L. Stewart; Mahmood Saair Quaderi; Lena Nyberg; Vilhelm Müller; Santosh Kumar Bikarolla; Erik Kristiansson; L. Sandegren; Fredrik Westerlund; Tobias Ambjörnsson

Publiceringsår: 2018

Publicerat i: PLoS ONE

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
The neuroendocrine phenotype, genomic profile and therapeutic sensitivity of GEPNET cell lines

Författare: Tobias Hofving; Yvonne Arvidsson; Bilal Almobarak; Linda Inge; Roswitha Pfragner; Marta Persson; Göran Stenman; Erik Kristiansson; Viktor Johanson; Ola Nilsson

Publiceringsår: 2018

Publicerat i: Endocrine-Related Cancer

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
ECOdrug: A database connecting drugs and conservation of their targets across species

Författare: Bas Verbruggen; Lina-Maria Gunnarsson; Erik Kristiansson; Tobias Österlund; Stewart F. Owen; Jason R. Snape; Charles R. Tyler

Publiceringsår: 2018

Publicerat i: Nucleic Acids Research

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Functional metagenomics reveals a novel carbapenem-hydrolyzing mobile beta-lactamase from Indian river sediments contaminated with antibiotic production waste

Författare: Nachiket Marathe; Anders Janzon; S. Kotsakis; Carl-Fredrik Flach; Seyed Mohammad Razavizadeh; Fanny Berglund; Erik Kristiansson; D. G. Joakim Larsson

Publiceringsår: 2018

Publicerat i: Environment International

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
2017
Computational and Statistical Considerations in the Analysis of Metagenomic Data

Författare: Fredrik Boulund; Mariana Buongermino Pereira; Viktor Jonsson; Erik Kristiansson

Publiceringsår: 2017

Publicerat i:

Publikationstyp: Kapitel i bok
Identification of 76 novel B1 metallo-beta-lactamases through large-scale screening of genomic and metagenomic data

Författare: Fanny Berglund; Nachiket Marathe; Tobias Österlund; Johan Bengtsson-Palme; S. Kotsakis; Carl-Fredrik Flach; D. G. Joakim Larsson; Erik Kristiansson

Publiceringsår: 2017

Publicerat i: Microbiome

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Using metagenomics to investigate human and environmental resistomes

Författare: Johan Bengtsson-Palme; D. G. Joakim Larsson; Erik Kristiansson

Publiceringsår: 2017

Publicerat i: Journal of Antimicrobial Chemotherapy

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
HirBin: High-resolution identification of differentially abundant functions in metagenomes

Författare: Tobias Österlund; Viktor Jonsson; Erik Kristiansson

Publiceringsår: 2017

Publicerat i: BMC Genomics

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Draft Genome Sequences of Six Strains of Streptococcus pneumoniae from Serotypes 5, 6A, 6B, 18C, 19A, and 23F

Författare: Hedvig E. Jakobsson; Francisco Salvà-Serra; Kaisa Thorell; Roger Karlsson; L. Gonzales-Siles; Fredrik Boulund; Lars Engstrand; Erik Kristiansson; Edward R.B. Moorea

Publiceringsår: 2017

Publicerat i: Genome Announcements

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Typing and Characterization of Bacteria Using Bottom-up Tandem Mass Spectrometry Proteomics

Författare: Fredrik Boulund; R. Karlsson; L. Gonzales-Siles; Anna Johnning; N. Karami; O. Al-Bayati; C. Ahren; E. R. B. Moore; Erik Kristiansson

Publiceringsår: 2017

Publicerat i: Molecular and Cellular Proteomics

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Untreated urban waste contaminates Indian river sediments with resistance genes to last resort antibiotics

Författare: Nachiket Marathe; C. Pal; Swapnil S. Gaikwad; Viktor Jonsson; Erik Kristiansson; D. G. Joakim Larsson

Publiceringsår: 2017

Publicerat i: Water Research

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Does antifouling paint select for antibiotic resistance?

Författare: Carl-Fredrik Flach; C. Pal; Carl Johan Svensson; Erik Kristiansson; M. Ostman; Johan Bengtsson-Palme; M. Tysklind; D. G. Joakim Larsson

Publiceringsår: 2017

Publicerat i: Science of the Total Environment

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift

Gå till Chalmers publikationsbibliotek

Chalmers styrkeområde Life Science

Publicerad: fr 19 apr 2013. Ändrad: on 02 jan 2019

Erik Kristiansson

Senaste publikationer

2019

2018

2017

Projekt

Avslutade