Erik Kristiansson

Professor, Matematiska vetenskaper

erik.kristiansson@chalmers.se +46317723521 Hitta till mig

My research focuses on analysis of quantitative data with applications in molecular biology and medicine.

More information about me and my research group is available at http://bioinformatics.math.chalmers.se/erikkristiansson/erikkristiansson.html

Undervisning
Publikationer
Samverkan och projekt

TMS145, MVE350, MVE405

Senaste publikationer

2022
The impact of the ST131 clone on recurrent ESBL-producing E. coli urinary tract infection: a prospective comparative study

Författare: Anna Lindblom; Camilla Kiszakiewicz; Erik Kristiansson; Shora Yazdanshenas; Nina Kamenska; Nahid Karami; Christina Ahren

Publiceringsår: 2022

Publicerat i: Scientific Reports

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
The curse of the uncultured fungus

Författare: Kessy Abarenkov; Erik Kristiansson; M. Ryberg; Sandra Nogal-Prata; Daniela Gómez-Martínez; Katrin Stüer-Patowsky; Tobias Jansson; Sergei Põlme; Masoomeh Ghobad-Nejhad; Natàlia Corcoll; Ruud Scharn; Marisol Sánchez-García; Maryia Khomich; Christian Wurzbacher; R. Henrik Nilsson

Publiceringsår: 2022

Publicerat i: MycoKeys

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
GEnView: a gene-centric, phylogeny-based comparative genomics pipeline for bacterial genomes and plasmids

Författare: Stefan Ebmeyer; Roelof Dirk Coertze; Fanny Berglund; Erik Kristiansson; D. G. Joakim Larsson

Publiceringsår: 2022

Publicerat i: Bioinformatics

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Large-scale characterization of the macrolide resistome reveals high diversity and several new pathogen-associated genes

Författare: David Lund; Nicolas Kieffer; Marcos Parras Moltó; Stefan Ebmeyer; Fanny Berglund; Anna Johnning; D. G.Joakim Larsson; Erik Kristiansson

Publiceringsår: 2022

Publicerat i: Microbial Genomics

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Estimating the release of chemical substances from consumer products, textiles and pharmaceuticals to wastewater

Författare: Mikael Gustavsson; Sverker Molander; Thomas Backhaus; Erik Kristiansson

Publiceringsår: 2022

Publicerat i: Chemosphere

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
2021
Detection of structural variations in densely-labelled optical DNA barcodes: A hidden Markov model approach

Författare: Albertas Dvirnas; Callum L. Stewart; Vilhelm Müller; Santosh Kumar Bikarolla; Karolin Frykholm; L. Sandegren; Erik Kristiansson; Fredrik Westerlund; Tobias Ambjörnsson

Publiceringsår: 2021

Publicerat i: PLoS ONE

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Does the scientific knowledge reflect the chemical diversity of environmental pollution? – A twenty-year perspective

Författare: Erik Kristiansson; Jessica Coria; Lina-Maria Gunnarsson; Mikael Gustavsson

Publiceringsår: 2021

Publicerat i: Environmental Science and Policy

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
SMAD4 haploinsufficiency in small intestinal neuroendocrine tumors

Författare: Tobias Hofving; Erik Elias; Anna Rehammar; Linda Inge; Gülay Altiparmak; Marta Persson; Erik Kristiansson; Martin E. Johansson; Ola Nilsson; Yvonne Arvidsson

Publiceringsår: 2021

Publicerat i: BMC Cancer

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
A framework for identifying the recent origins of mobile antibiotic resistance genes

Författare: Stefan Ebmeyer; Erik Kristiansson; D. G. Joakim Larsson

Publiceringsår: 2021

Publicerat i: Communications Biology

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
An updated phylogeny of the metallo-β-lactamases

Författare: Fanny Berglund; Anna Johnning; D. G.Joakim Larsson; Erik Kristiansson

Publiceringsår: 2021

Publicerat i: Journal of Antimicrobial Chemotherapy

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
2020
Comprehensive screening of genomic and metagenomic data reveals a large diversity of tetracycline resistance genes

Författare: Fanny Berglund; Maria Elisabeth Böhm; Anton Martinsson; Stefan Ebmeyer; Tobias Österlund; Anna Johnning; D. G. Joakim Larsson; Erik Kristiansson

Publiceringsår: 2020

Publicerat i: Microbial Genomics

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
MYO5B Mutations in Pheochromocytoma/Paraganglioma Promote Cancer Progression

Författare: F. Abel; T. Tesan Tomic; J. Olausson; A. Rehammar; L. Deland; A. Muth; K. Ejeskar; Staffan Nilsson; Erik Kristiansson; O. Nilsson

Publiceringsår: 2020

Publicerat i: Abstracts from the 52th Congress of the International Scoiety of Paediatric Oncology (SIOP)

Publikationstyp: Paper i proceeding
Predicting clinical resistance prevalence using sewage metagenomic data

Författare: Antti Karkman; Fanny Berglund; Carl-Fredrik Flach; Erik Kristiansson; D. G. Joakim Larsson

Publiceringsår: 2020

Publicerat i: Communications Biology

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
When mycologists describe new species, not all relevant information is provided (clearly enough)

Författare: Louisa Durkin; Tobias Jansson; Marisol Sanchez; Maryia Khomich; Martin Ryberg; Erik Kristiansson; R. Henrik Nilsson

Publiceringsår: 2020

Publicerat i: MycoKeys

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Phosphorylated CtIP bridges DNA to promote annealing of broken ends

Författare: Robin Öz; Sean Howard; Rajhans Sharma; Hanna Törnkvist; Ilaria Ceppi; Sriram Kesarimangalam; Erik Kristiansson; Petr Cejka; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2020

Publicerat i: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
The Association between Insertion Sequences and Antibiotic Resistance Genes

Författare: Mohammad Razavi; Erik Kristiansson; Carl-Fredrik Flach; D. G. Joakim Larsson

Publiceringsår: 2020

Publicerat i: mSphere

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Structural and biochemical characterization of the environmental MBLs MYO-1, ECV-1 and SHD-1

Författare: Christopher Fröhlich; Vidar Sørum; Sandra Huber; Ørjan Samuelsen; Fanny Berglund; Erik Kristiansson; Stathis D. Kotsakis; Nachiket Marathe; D. G. Joakim Larsson; Hanna Kirsti S. Leiros

Publiceringsår: 2020

Publicerat i: Journal of Antimicrobial Chemotherapy

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
A comprehensive survey of integron-associated genes present in metagenomes

Författare: Mariana Buongermino Pereira; Tobias Österlund; Martin Eriksson; Thomas Backhaus; Marina Axelson-Fisk; Erik Kristiansson

Publiceringsår: 2020

Publicerat i: BMC Genomics

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Triclosan changes community composition and selects for specific bacterial taxa in marine periphyton biofilms in low nanomolar concentrations

Författare: Martin Eriksson; Sanli Kemal; Nilsson Rickard Henrik; Eiler Alexander; Corcoll Natalia; Johansson Carl Henrik; Backhaus Thomas; Blanck Hans; Erik Kristiansson

Publiceringsår: 2020

Publicerat i: Ecotoxicology

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
MYO5B mutations in pheochromocytoma/paraganglioma promote cancer progression

Författare: Tajana Tesan Tomic; Josefin Olausson; Anna Rehammar; Lily Deland; Andreas Muth; K. Ejeskar; Staffan Nilsson; Erik Kristiansson; Ola Nilsson Wassén; Frida Abel

Publiceringsår: 2020

Publicerat i: PLoS Genetics

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Cultivation-Free Typing of Bacteria Using Optical DNA Mapping

Författare: Vilhelm Müller; My Nyblom; Anna Johnning; Marie Wrande; Albertas Dvirnas; Sriram Kesarimangalam; Christian G. Giske; Tobias Ambjörnsson; L. Sandegren; Erik Kristiansson; Fredrik Westerlund

Publiceringsår: 2020

Publicerat i: ACS Infectious Diseases

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Discovery of Species-unique Peptide Biomarkers of Bacterial Pathogens by Tandem Mass Spectrometry-based Proteotyping

Författare: Roger Karlsson; Annika Thorsell; Margarita Gomila; Francisco Salva-Serra; Hedvig E. Jakobsson; Lucia Gonzales-Siles; Daniel Jaen-Luchoro; Susann Skovbjerg; Johannes Fuchs; Anders Karlsson; Fredrik Boulund; Anna Johnning; Erik Kristiansson; Edward R. B. Moore

Publiceringsår: 2020

Publicerat i: Molecular and Cellular Proteomics

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Long-term application of Swedish sewage sludge on farmland does not cause clear changes in the soil bacterial resistome

Författare: Carolin Rutgersson; Stefan Ebmeyer; Simon Bo Lassen; Antti Karkman; Jerker Fick; Erik Kristiansson; Kristian K. Brandt; Carl-Fredrik Flach; D. G. Joakim Larsson

Publiceringsår: 2020

Publicerat i: Environment International

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
2019
The mobile FOX AmpC beta-lactamases originated in Aeromonas allosaccharophila

Författare: Stefan Ebmeyer; Erik Kristiansson; D. G. Joakim Larsson

Publiceringsår: 2019

Publicerat i: International Journal of Antimicrobial Agents

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift
Modelling of zero-inflation improves inference of metagenomic gene count data

Författare: Viktor Jonsson; Tobias Österlund; Olle Nerman; Erik Kristiansson

Publiceringsår: 2019

Publicerat i: Statistical Methods in Medical Research

Publikationstyp: Artikel i vetenskaplig tidskrift

Gå till Chalmers publikationsbibliotek

Chalmers styrkeområde Life Science

Sidansvarig Publicerad: må 22 jun 2020.

Erik Kristiansson

Senaste publikationer

2022

2021

2020

2019

Projekt

Avslutade